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  • 单细胞基因组测序

    产品介绍常见问题经典案例


    单细胞基因组测序

    产品介绍常见问题经典案例


    先进的技术,大有用武之地

    单细胞测序通过对单个细胞进行基因组扩增和测序,
    解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题,
    为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向,
    为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。

    科学方案设计

    从材料选取,建库测序,到数据分析,
    每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    信息分析

    单细胞测序可针对性揭示单个细胞整体水平的基因信息,解决了细胞异质性难题。
    可最真实的获得单克隆细胞的具体突变来源及精准的突变频率,
    用来研究疾病以及癌症发生发展机制等。

    Single cell 全基因组/外显子组测序
    癌症基因组学 疾病基因组学
    标准信息分析A 标准信息分析A+ 标准信息分析Pro

    去除接头污染序列及低质量数
    据比对,产出数据统计SNP检
    测、注释和统计InDel检测、注
    释和统计CNV检测、注释和统
    计(仅全基因组测序)SV检
    测、注释和统计(仅全基因组
    测序)

    1. 数据质控:去除接头污染和
    低质量数据
    2. 与参考序列进行比对、统计
    测序深度及覆盖度
    3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV检测、注释及统计(肿瘤成
    对样本)

    1. 数据质控:去除接头污染和低质量
    数据
    2. 与参考序列进行比对、统计测序深
    度及覆盖度
    3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV检
    测、注释及统计(肿瘤成对样本)
    4. 单细胞Germline SNP聚类分析
    5. PAC(主成分)分析
    6. Heatmap展示图(somatic
    SNV)
    7. 高频突变分析(>2对样本)
      7.1高频突变基因统计
      7.2高频突变基因富集分析
    8. NMF突变特征/突变频谱分析
      8.1突变频谱分析
      8.2NMF突变特征分析(>2对样
    本)
    9. NovoDriver已知驱动基因筛选
    10. 基因组变异Circos图展示

    1. 样本间协同性分析(肿瘤单细胞样
    本数量≥2,且必须有组织样本)
    2. MRT高频突变基因相关性分析(>
    2对样本)
      2.1高频突变基因协同作用分析
      2.2高频突变基因互斥作用分析
    3. OncodriveCLUST驱动基因预测
    (>2对样本)
    4. 突变位点分布情况分析
      4.1高频突变基因SNV/InDel突变
    位点展示
      4.2预测驱动基因SNV/InDel突变
    位点展示
    5. 高频CNV分析
      5.1 CNV分布分析
      5.2 CNV重现性分析(>2对样
    本)
    6. 杂合性缺失(LOH)分析
    7. LOF蛋白功能缺失分析
    8. NovoDrug高频突变基因靶向用药
    预测
    9. NovoDR耐药突变筛选
    10. NovoNoncoding非编码区高频
    突变分析(单细胞外显子测序仅不包
    括此分析)

    * 定制化信息分析,可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容

    悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

    基因组测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
    诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
    实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
    以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

    出色完成每一个项目环节,助力科学研究

    采用国际认可的全基因组扩增技术

    多次退火环状循环扩增技术
    (Multiple annealing and looping-based amplification cycles, MALBAC),具有低偏倚性。

    定制化信息分析

    针对不同项目,除了进行标准信息分析外,通过与合作伙伴共同探讨,制定可行的个性化信息分析方案,整合各种主流软件,优化分析结果,以确保结果的准确性及创新性。

    丰富的项目经验

    诺禾致源已成功完成单精子全基因组测序、单细胞转录组测序等,相关研究成果在Science、 Nature等顶级科学期刊发表。

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