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  • 微生物重测序

    产品介绍常见问题经典案例结果展示


    一站式解析变异与差异

    微生物种类繁多,菌株的分化速度快,需要有一个经济快速的方法,
    对大范围内的海量菌株进行测序研究,了解菌株间的变异信息。
    微生物基因组的重测序,是基于小片段文库的高通量测序数据,与近缘参考基因组进行比对,进行变异检测的方法。
    检测获得菌株和参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息,以精准快捷为特点,
    系统全面的检测变异信息。同时还可进一步进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。

    精准、快捷、多样化重测序方案

    微生物重测序产品,以精准快捷为核心,切中核心目标,
    准确检测菌株间的重要变异信息。

    产品 测序平台 测序策略 检测内容 项目周期
    细菌重测序 Illumina PE150 350 bp文库 ≥ 100 X SNP、InDel、SV 30个自然日
    真菌重测序 Illumina PE150 350 bp文库 ≥ 30 X SNP、InDel、SV、CNV 30个自然日

    科学方案设计

    从材料选取,建库测序,到数据分析,
    每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    信息分析

    分析内容=标准分析+高级分析。
    深入到位的数据分析可系统、全面了解样本的信息。变异检测只是重
    测序的数据基础,基于数据的挖掘,才是解释生物学问题的桥梁。一
    系列的信息分析,帮助我们更好的解读数据,了解菌株进化、选择和
    传播等重要问题。

    分析内容 解决问题
    变异检测 准确定位变异位点
    基本进化分析 构建系统进化树
    确定菌株间进化关系
    地域归属分析 研究菌株的地域传播规律
    分歧时间估计 讨论菌株支系之间的分化历史
    选择压力分析 菌株进化过程中的选择压力
    揭示与环境相关的关键基因
    变异基因功能富集 统计变异基因分布规律
    寻找变异丰富的功能分类

    悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

    微生物基因组重测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
    诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
    实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
    以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

    出色完成每一个项目环节

    诺禾致源微生物合作遍布全球,截止2017年12月,已发表20余篇微生物文章,微生物单菌完成样品数超过20000例,
    项目合作领域涵盖了致病菌、益生菌、食用菌、药用菌株、工业菌株等广泛领域。
    “科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
    确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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