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  • 16S、18S、ITS等扩增子测序

    产品介绍常见问题经典案例结果展示


    16S、18S、ITS等扩增子测序

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    一步到位检测环境微生物多样性

    扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。
    16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,
    通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
    16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
    ITS分为两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于5.8S和28S之间。

    读长长, 周期短, 性价比高。

    采用Ion S5 XL测序平台,以半导体测序技术为核心,直接将化学信号转换成数字信号,
    单端测序,无需拼接,平台重复性比Illumina测序平台更好,
    SE400/SE600两种模式,为扩增子测序提供更多的选择。

    科学方案设计

    从材料选取,建库测序,到数据分析,
    每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    信息分析

    分析内容=标准分析+高级分析。
    基于目标区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和
    群落结构差异性。

    高级分析 解决问题
    肠型分析 肠道菌准确定位和疾病预测和治疗
    PICRUSt 预测宏基因组的功能组成
    FAPROTAX 预测环境样本的生物化学循环过程
    Tax4fun 肠道、土壤等样品的功能预测
    FunGuild 预测真菌的生态功能
    标准分析 解决问题
    物种注释 物种注释及各物种丰度信息
    α-多样性分析 微生物群落的丰富度和多样性
    β-多样性分析 不同样本间的微生物群落
    及各样本差异情况
    多元统计分析 寻找组间具有显著差异的物种,
    同时可以比较组内差异和组间差异
    的大小,判断分组是否有意义
    CCA分析 研究物种组成与环境因子间的关系
    环境因子关联分析
    VPA分析

    扩增子测序解密环境微生物多样性

    诺禾致源基于多样性的测序区域选择,结合研究目的和样品自身的特点,
    灵活制定研究方案,用专业成熟的样本
    制备、建库以及数据分析流程,客观还原样品本身的菌群结构以及丰度。

    悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

    扩增子测序采用先进的Ion S5 XL测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
    诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
    实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
    以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

    项目经验丰富

    至2017年12月,诺禾致源诺禾16S样本数突破220,000例,
    包括土壤、水体、粪便、淤泥、发酵物等样本。
    “科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
    确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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